Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9CQF4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQF4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms