Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rab5aQ9CQD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rab5aQ9CQD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms