Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Chchd1Q9CQA6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Chchd1Q9CQA6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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