Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp2Q9CQ73 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms