Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efcab2Q9CQ46 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efcab2Q9CQ46 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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Efcab2Q9CQ46 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efcab2Q9CQ46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms