Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
StambpQ9CQ26 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StambpQ9CQ26 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms