Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp3Q9CQ10 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms