Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc18Q9CQ07 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc18Q9CQ07 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms