Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930519G04RikQ9CPT7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms