Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GpnmbQ99P91 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms