Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms