Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad54l2Q99NG0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad54l2Q99NG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad54l2Q99NG0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms