Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcgf6Q99NA9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcgf6Q99NA9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pcgf6Q99NA9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms