Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brms1Q99N20 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brms1Q99N20 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms