Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PccbQ99MN9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PccbQ99MN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms