Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gins4Q99LZ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins4Q99LZ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms