Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5rap3Q99LM2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5rap3Q99LM2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms