Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nus1Q99LJ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms