Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PpifQ99KR7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PpifQ99KR7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms