Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf34Q99KR6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf34Q99KR6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms