Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Reep3Q99KK1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep3Q99KK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms