Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krcc1Q99JT5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krcc1Q99JT5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms