Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psip1Q99JF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psip1Q99JF8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms