Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pacsin3Q99JB8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pacsin3Q99JB8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms