Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Def8Q99J78 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Def8Q99J78 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms