Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec3Q99J72 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apobec3Q99J72 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms