Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc8b1Q925Q3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms