Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms