Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csmd1Q923L3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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