Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b5Q923D4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms