Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca5Q91ZW3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms