Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx18Q91ZR2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms