Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Basp1Q91XV3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms