Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd3Q91WC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Setd3Q91WC0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms