Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usb1Q91W78 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms