Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NifkQ91VE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NifkQ91VE6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms