Protein–RNA interactions for Protein: Q91V04

Tram1, Translocating chain-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tram1Q91V04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tram1Q91V04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tram1Q91V04 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms