Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms