Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cul7Q8VE73 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cul7Q8VE73 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms