Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fyco1Q8VDC1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fyco1Q8VDC1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms