Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d2Q8VD57 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms