Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sco2Q8VCL2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sco2Q8VCL2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms