Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Top1mtQ8R4U6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Top1mtQ8R4U6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Top1mtQ8R4U6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top1mtQ8R4U6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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