Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpm8Q8R4D5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpm8Q8R4D5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms