Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms