Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim29Q8R2Q0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 446.4 ms