Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E3

Vmn1r36, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r36Q8R2E3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r36Q8R2E3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms