Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2f2Q8R0A0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms