Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3b4Q8QZY9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms