Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc12Q8K5B8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms